研究报告

番茄TCP转录因子家族的鉴定和生物信息学分析  

李菲* , 何小红 , 张宇斌 , 乙引*
贵州师范大学生命科学学院, 植物生理与发育调控贵州省重点实验室, 贵阳, 550025
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 3 篇   
收稿日期: 2017年02月23日    接受日期: 2017年03月09日    发表日期: 2019年01月18日
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摘要

      TCP 转录因子家族是植物特有的基因家族,处于植物多种信号传导途径的中心节点位置,在各种信号传导途径的交叉处起重要作用,调节植物关键的生理生化过程。利用番茄的基因组测序数据,我们对番茄全基因组的 TCP 基因进行筛选、鉴定和分析。番茄基因组中共有 36 个 TCP 基因。这些基因的蛋白质特征,如大小和等电点,差异较大。应该与 TCP 基因处在信号传导网络的节点,需要与各种各样的蛋白质特异性结合有关。番茄 TCP 基因结构较为简单,一般不含内含子。但是三号和六号染色体上的 9 个 TCP 基因,有5 个基因带有一个内含子。系统进化分析表明这五个基因亲缘关系较近。番茄与拟南芥、水稻 TCP 家族的系统进化分析表明,番茄的全部 TCP 基因和水稻的基因亲缘关系更近。水稻 TCP 基因的功能信息,可以给我们提供番茄对应基因的功能信息。

关键词
西红柿;信号传导;系统进化;TCP

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《分子植物育种》印刷版
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